Academische ziekenhuizen blijven in de praktijk in veel gevallen vergunningplichtig door andere Bor categorieën dan 23. Bijvoorbeeld door het gebruik van biologische agentia of door de opslag van bepaalde stoffen. Zie verder onze vraag en antwoord.
Voor groenafval afkomstig van eigen werkzaamheden bestond al vrijstelling van de vergunningplicht; sinds de vierde tranche geldt deze vrijstelling ook voor groenafval afkomstig van derden.
Voor een aantal materialen bestond al een vrijstelling van de vergunningplicht voor het inzetten ervan in een productieproces (metaal, hout, kunststof, textiel, steenachtig materiaal of gips). Sinds de vierde tranche wijzigingen geldt deze vrijstelling ook voor bont, leer, rubber, papier en karton.
Voor het opslaan van afvalstoffen van de gezondheidszorg is in de vierde tranche de OBM-plicht grotendeels geschrapt. Alleen voor afvalstoffen van de gezondheidszorg die verwijderd moeten worden (zoals cytotoxische en cytostatische geneesmiddelen of infectueuze afvalstoffen) is nog een OBM nodig.